育种者应提交相应的申请文件。文件内容包括：植物新品种权请求书、说明书和照片。
文件准备齐全后，申请林业植物新品种权的申请人，可以直接向国家林业局提出申请，也可委托国家林业局指定的代理机构代理申请。对于申请品种权的育种者，可以直接向国家林业局植物新品种保护办公室递交申请文件，也可通过邮局邮寄申请文件。
申请文件递交后，申请人所申请的保护品种将在国家林业局下发的书面公告或网上进行公告，如果在公告期没有任何人对该品种提出质疑，该申请人将获得新品种保护权。

国家林业局负责林木、竹、木质藤本、木本观赏植物（包括木本花卉）、果树（干果部分）及木本油料、饮料、调料、木本药材等植物新品种保护。

一般来说，木本植物培育的时间较长，因此保护的期限也较长。我国已有明确规定：藤本植物、林木、果树和观赏树木的品种权保护期限为20年，其他15年 。

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